같은 등록에 관계되는 재산이 둘 미상의 지방자치단체에 걸쳐 있어 등록면허세를 지방자치단체별로 부과할 수 없을 때에는 등록관청 소재지를 납세지로 한다.

「여신전문금융업법」제2조 제12호에 따른 할부금융업을 영위하기 위하여 대도시에서 법인을 설립함에 따른 등기를 할 때에는 그 세율을 해당 표준세율의 100분의300으로 한다. 단， 그 등기일부터 2년 이내에 업종변경이나 업종추가는 없다.

무덤과 이에 접속된 부속시설물의 부지로 사용되는 토지로서 지적공부상 지목이 묘지인 토지에 관한 등기에 대하여는 등록면허세를 부과하지 아니한다.

재산권 기타 권리의 설정 • 변경 또는 소멸에 관한 사항을 공부에 등기 또는 등록을 받는 등기 • 등록부상에 기재된 명의자는 등록면허세를 납부할 의무를 진다.

지방자치단체의 장은 조례로 정하는 바에 따라 등록면허세의 세율을 부동산 등기에 대한 표준세율의 100분의 50의 범위에서 가감할 수 있다.